新疆吉木薩爾縣西距首府烏魯木齊市160公里，是一座歷史悠久，風光迷人，交通發達的新型化城市，是國家園林縣城，全國科技進步縣，全國科普示范縣，擁有國家級重點文物保護遺址北庭古城西大寺、世界文化遺產北庭都護府、五彩灣古海溫泉、生態主題公園-天地園、野馬中心以及貫穿天山通往吐魯番的車師古道等景區和自然景觀，是新疆旅游勝地之一。礦產資源豐富，石油和煤炭儲量居全國首位。國家級準東五彩灣煤電煤化工工業基地坐落于縣域境內。 醫院建于1952年，是一所二級甲等綜合醫院，2023年占地面積12.43萬平米，投資4.9億元的新院區將投入使用。

醫院現有職工585人，有高級職稱77人，中級職稱80人，縣級優秀骨干人才30名。有漢族、回族、維吾爾族、哈薩克族、塔塔爾族等多個民族。開放床位400張，擁有1.5T核磁1臺，16排、64排螺旋CT 4臺、高中端彩超7臺、超高清腹腔鏡系統、全自動生化分析儀、網絡心電系統、遠程心電監護系統等高端設備，是中國人民解放軍總醫院(北京301醫院)、第三軍醫大學西南醫院、西安交大第一附屬醫院、新疆醫科大學第一附屬醫院、新疆自治區人民醫院技術協作醫院，并與這些醫院建立了遠程會診平臺，是福建廈門各大醫院援疆幫扶單位，同時和自治區多家醫院成立了醫聯體和專科聯盟。

有臨床科室14個,有7個縣級重點專科，一個州級高層次人才工作室，8個縣級高層次人才工作室。普外科成立腔鏡中心，常規開展結腸癌、肝、腎、膽囊、甲狀腺等疾病的微創手術，并對胃癌、食道癌、腸道腫瘤進行了規范化治療；泌尿外科開展經皮腎鏡鈥激光碎石取石術，胸外科開展胸腔鏡下肺大泡切除術等微創手術；骨科重點開展髖膝關節置換術、椎體成形術、韌帶修復術等高難度手術。2018年開始加強五大中心建設，同年10月建立了介入治療中心， 2020年11月認證為中國基層胸痛中心，神經醫學科于2019年12月由中國卒中學會認證為卒中中心，呼吸科開展了支氣管鏡下診斷與治療；婦產科開展陰道鏡、宮腔鏡下手術及診斷治療；眼科開展白內障超聲乳化+人工晶體植入、鼻腔淚囊吻合+置管術，五官科開展鼻內窺鏡下鼻息肉切除術+全組鼻竇開放術。康復科是醫院特色科室，開展疼痛康復、肢體康復、言語康復、心肺功能康復，利用智能機器人開展模擬步態訓練。重癥醫學科擁有先進的搶救設備及團隊，承擔著全縣急重癥患者的救治工作。內鏡中心開展鏡下消化道疾病、腫瘤的診斷，內鏡下異物取出術、止血術、消化道狹窄擴張術、胃造瘺術等內鏡治療。腎病科是全州縣級醫院中開展血液透析技術最早的科室。

2021年，醫院堅持“人才興院、科技強院”的發展戰略，面向社會及各大院校誠招各類醫學專業人才。